于晓庆

导师介绍

导师姓名

于晓庆

导师性别

女

职务职称

副教授

所在院系

理学院 应用数学系

一级学科

数学

二级学科

计算数学、应用数学

研究方向

计算生物学

联系电话

15216781778

电子邮箱

xqyu@sit.edu.cn

个人简介

于晓庆，副教授，硕士生导师，主要研究方向为计算生物学、生物信息学等。目前主要研究课题为人类复杂疾病相关分子生物标志物的识别分析与建模预测等。主持完成国家自然科学青年基金1项; 主编出版本科数学教材1部。曾获第二届上海高校青年教师教学竞赛二等奖、上海应用技术大学本科教学突出贡献教师教学成就奖一等奖等。

学习与工作经历

2021.01 – 至今   上海应用技术大学 应用数学系副教授

2016.07 – 2017.12    中国科学院系统生物学重点实验室 访问学者

2012.09 – 2020.12  上海应用技术大学   应用数学系讲师

2009.09 – 2012.07  上海师范大学计算数学博士

科研工作与成果

主要科研项目：

1、主持，国家自然科学基金青年基金项目，2018.01-2020.12，结题；

2、主持，上海高校青年教师培养资助计划项目， 2014.1-2015.12，结题；

主要代表论文（2011-至今）：

1. Xiaoqing   Yu, Jingsong Zhang, Rui Yang and Chun Li, Identification of Long   Noncoding RNA Biomarkers for Hepatocellular Carcinoma Using Single-Sample Networks[J].   BioMed Research International, 2020(12):1-12, 2020.

2. Jingsong Zhang, Jianming Guo, Ming Zhang, Xiangtian   Yu, Xiaoqing Yu, et al. Efficient   Mining Multi-mers in a Variety of Biological Sequences[J]. IEEE/ACM   Transactions on Computational Biology & Bioinformatics, PP(99):1-1, 2018.   

3. C. Li, W.C. Fen, Y. Zhao, Xiaoqing Yu. Novel graphical   representation and numerical characterization of DNA sequences. Applied Sciences,   6(3), 63, 2016. 

4. Xiaoqing Yu, X.Q. Zheng, C. Li, J.   Wang, A computational method of predicting regulatory interactions in   Arabidopsis based on gene expression data and sequence information, Computational   Biology and Chemistry, 51: 36-41, 2015.

5. C. Li,   Y. Yang, M.D. Jia, Y.Y. Zhang, Xiaoqing   Yu，C.Z. Wang, Phylogenetic analysis of DNA of   sequences based on k-word and rough set theory, Physica A, 398: 162-171,   2014.

6. Xiaoqing   Yu, X.Q. Zheng, T.G. Liu, Y.C. Dou, J. Wang, Prediction of apoptosis   protein subcellular location based on amino acid substitution matrix and auto   covariance transformation, Amino Acids, 42:1619-1625, 2012.

7. Xiaoqing   Yu, X.Q. Zheng, L.Y. Meng, C. Li，J.   Wang, A support vector machines based method to predict success for   polymerase chain reactions. Combinatorial Chemistry & High Throughput   Screening, 15: 486-491, 2012.

8. Xiaoqing   Yu, T.G. Liu, X.Q. Zheng, Z.N. Yang, J. Wang, Prediction of regulatory   interactions in Arabidopsis using gene expression data and support vector   machines, Plant Physiology and Biochemistry, 49: 280-283, 2011.

主要研究方向

主要研究方向为计算生物学，目前主要的研究课题为人类复杂疾病相关分子生物标志物的识别分析和建模预测等工作。

近3年指导研究生的就业情况

目前指导在读研究生2名。